La famille Hattori était une famille respecté du pays du feu , elle fondât une école d'arts martiaux spécialisé qui combine techniques d'assassinat et tactiques de combat peu conventionnelles . Ils ont longtemps utilisé leur Ninjutsu pour conserver leur indépendance contre les seigneurs féodaux , et ainsi se faire connaître en tant que mercenaires. La tradition d'indépendance est restée forte au sein du clan . Leur Ninjutsu reste un art obscur, transmis de père en fils et jalousement gardé hors des regards étrangers .

Le clan Hattori acquis donc sa notoriété grâce à ses aptitudes dans l'espionnage et l'assassinat , autrefois sans affiliations . La légende dit que l'ainé du clan eu alors une altercation avec Eiko Uchiha qui était à l'époque le Nidaime Hokage , le combat durât trois jours et trois nuits , durant lesquels aucun des deux protagonistes eurent l'avantage , et c'est à ce moment que les deux être furent attaqué par des ninja de Kiri , L'ainé Hattori du faire alliance avec celui qui fut son adversaire , une fois défaits de leur ennemis commun , les deux hommes eurent un respect mutuel et depuis le clan Hattori se mit au service de Konoha-no-kagure.