Les membres d'un clan évoluent différemment des autres ninjas et samourais. L'enseignement académique proposé par les villages est moins intéressant que celui du clan, étant héréditaire. Voici comme cela se déroule :

Spécialités et capacités spéciales pour Ninjas de clans.
Spécialités : Ninjutsu, Taijutsu, Genjutsu
Capacité spéciale : Techniques de clan.

Étudiant : Techniques de base
Genin : Techniques de clan
Chunin : Une première spécialité
Jonin : Une deuxième spécialité

Spécialités et capacités spéciales pour Samouraïs de clans.
Spécialités : Kenjutsu, Kyujutsu, Shinjutsu
Capacité spéciale : Techniques de clan

Disciple : Techniques de base
Ashigaru : Techniques de clan
Bushi : Une première spécialité
Hatamoto : Une deuxième spécialité